扶養控除等異動申告書の提出があったため、今年ずっと甲欄を使用して給与計算をしていた従業員がおりますが、年末調整時期になり、他社で年末調整を受けていますとの報告がありました。

この場合、今年一年のお給料を遡って乙欄で計算しなおし、まとめて１２月末の給与から所得税控除すればよいのでしょうか？
それとも１２月末支払いの給与から乙欄で所得税控除し、本人が確定申告をするはずなので、遡っての控除は不要なのでしょうか？
ご教示いただけると幸いです。